Công ty tiền thân là Đội Quản lý thủy nông được thành lập năm 1968, năm 1971 được thành lập Trạm Quản lý thủy nông. Để đáp ứng yêu cầu phục vụ sản xuất nông nghiệp Trạm được nâng cấp cho phù hợp với từng thời kỳ.
Trải qua 45 năm xây dựng và trưởng thành, có bề dày trong công tác chỉ đạo và điều hành quản lý, tổ chức thực hiện nhiệm vụ. Tập thể cán bộ, công nhân viên chức lao động trong Công ty ngày càng trưởng thành, trình độ tay nghề ngày càng được nâng lên để đáp ứng yêu cầu hiện nay.